Reactor

Reactor:バーチャルリアクションエンジン

合成可能なバーチャルライブラリーの作成

Reactorはジェネリックな反応を用いてバーチャルライブラリーを作成するためのソフトウェアです。単にバーチャルな分子を作るのではなく、化学的に意味があり、合成できる可能性の高い化合物を生成するユニークなアプローチを採用しています。

Chemical Term

ケミカルタームとはChemAxonが考案した化学的ルールを記述するための言語で、化合物の物理化学的パラメータなどを複数組み合わせて、検索や条件設定に用いる事ができます。 Reactorでは、ジェネリックな反応の定義にChemical Termを利用しています。

Reaction Library

Reactorではジェネリックな反応をライブラリーとして提供致します。ChemAxonの提供するリアクションライブラリーは、単にジェネリックな構造（リアクタント、プロダクト）から反応を構成するだけでなく、反応が起こる種々の条件を組み合わせています。このユニークなアプローチによって、Reactorによって生成されたバーチャルライブラリーは実際に合成できる可能性が高くなっています。

多段階反応のサポート
シーケンシャルモード、コンビナトリアルモードでの変換
各種ファイルフォーマットのサポート
高速なバーチャルライブラリの生成

Reaction Libraryの例： Friedel-Crafts acylation

C(a): aromatic carbon atom
L[O, S]: oxygen or sulfur atom
L[Cl, Br, I]: chlorine, bromine or iodine atom

REACTIVITY: charge(ratom(1), "aromaticsystem") < -0.2
SELECTIVITY: -energyE(ratom(1))
TOLERANCE:0.02

Directing rule: the electrophilic substitution takes place on the aromatic carbon atom with the lowest localization energy having an attached electrophile in the transition state. Aromatic carbon with the lowest localization energy provides the main product. Other aromatic carbons having similar localization energies (with less difference than 0.02) are also considered to lead to main products.

EXCLUDE: match(ratom(2), "[C:1]C=C", 1) &&
match(reactant(0), "[#15][H]") &&
(max(pka(reactant(0), filter(reactant(0),
"match('[O,S;H1]')"), "acidic")) > 14.5) &&
(max(pka(reactant(0), filter(reactant(0),
"match('[#7:1][H]', 1)"), "basic")) > 0)

Exclude aromatic compounds containing nucleophilic groups (but do not exclude phenols) and also exclude acrylic halides.

ChemAxon（ケムアクソン）日本語ホームページ

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Reaction Libraryの例： Friedel-Crafts acylation

アニメーションによる機能紹介（英語）

関連リンク（英語）

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