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Fragmenter:インテリジェントなフラグメント化ツール
効率的なバーチャルビルディングブロックの作成
Fragmenterはドラッグデザインに用いるビルディングブロックを作成するためのソフトウェアです。 Fragmenterは与えられた分子をフラグメントに分解しますが、この時各フラグメントは切断に関する情報を保持しますので、これらのフラグメント情報を用いてバーチャルライブラリーを作成する事ができます。
RECAP
FragmenterにはRECAPフラグメンテーションモジュールが付属しています。RECAP (Retrosynthetic Combinatorial Analysis Procedure) によるフラグメント化は確立した合成方法をベースとしていますので、この方法で生成されたフラグメントによって作られる化合物は、実際に合成できる可能性が高くなります。J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1998. 38. 511-522
Fragment
フラグメントは切断情報を含んでいるので、フラグメントから新たな化合物を作ることが迅速に行えます。
- フラグメント作成ルールはカスタマイズする事ができます。
- フラグメントの統計情報が得られます。
- 高速なフラグメント発生アルゴリズムを採用しています。
- 網羅的なフラグメント化が可能です。
- フラグメント解析
入力構造に関連づけられた活性値などの情報は、フラグメント作成において、順位付けやフィルターリングに用いることができます。関連付けられたデータやフラグメントの大きさ、頻度に基づいてスコア化を行い、フラグメントの絞込みができます。
Rグループの分解
Fragmenterは化合物群をRグループに分解し、骨格と特定位置のフラグメントを特定する事ができます。
各種ファイルフォーマットをサポート
MOL, MRV, RXN, SMILES, SMARTS, CML, SD File, RD File などのファイルを読み込む事ができます。
インテグレーション
Fragmenterは他のChemAxon社製品と簡単にインテグレーションする事ができます。
関連リンク（英語）
- Download
- History of Changes
- User Guide
- JChem technical introduction
- Brochure
- Technical presentation
- Articles and Presentations
更新日：2008年1月 1日 | 本記事のURL
