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MarvinSpace:高品質3次元分子モデル表示ツール
JAVAによる高品質分子3次元分子モデル表示ソフト
Marvin SpaceはJavaベースの高品質分子グラフィックス表示ツールです。
低分子からタンパク質などの巨大分子のスムーズな３次元表示を行います。
Marvin Spaceはスタンドアロンの構造ブラウジングツールとしての利用はもちろん、Webアプリケーションやカスタムアプリケーションに組み込んでご利用することもできます。また、JAVAベースのソフトであり、WindowsだけでなくMACやLINUXなど幅広い環境でご利用いただけます。
表示機能
Marvin Spaceでは様々は表示が行えます。ワイヤーフレーム。ボールアンドスティック、スペースフィル形式が選択でき、それらを組み合わせることもできます。
また、それぞれドット表示、メッシュ表示、ソリッド表示、透過性表示が選択できます。
サーフェイス
Marvin Spaceはスムーズでかつ正確なサーフェイスを表示します。ファンデルワールス、コノリー、ソルベントアクセシブル、ブロビーサーフェイスの表示ができます。
より滑らかな表面の描画を実現するトライアングルリダクションや表面を透過性表示にすることもサポートされています。
プロパティーマッピング
原子、アミノ酸残基、チェイン、２次構造、静電ポテンシャルにもとづいて表示モデルに色をつけることができます。
またCalculator Pluginsなどで計算された物性値を分子上にマッピングすることも可能です。
ガウシアンキューブファイルなどのボリュームデータの取り込みやイソサーフェイスの閾値の対話的変更もサポートされています。
巨大分子の表示
タンパク質などの巨大分子の表示が行えます。
その他の機能
その他の機能蛋白の２次構造表示、リガンドバインディングの表示、様々なラベルの表示と編集、距離・角度・二面角の表示、トーション角の操作、ファーマコファーモデルの表示などが行えます。
MarvinSpaceイメージギャラリー
以下のグラフィックスをクリックするとイメージギャラリーへ移動します。
MarvinSpaceを実際に動かしてみましょう。
更新日：2008年1月 1日 | 本記事のURL
MarvinSpaceオンライントライアル
MarvinSpaceを実際に動かしてみましょう。
以下の画像をクリックするとMarvinSpaceを起動し、3次元分子モデルをレンダリング・表示します。
ご注意：
- 予めブラウザのポップアップブロック機能を無効にしてからご利用下さい。
- 初回の起動時にはアプレットダウンロードの為若干お時間を要します。
- ご利用にはJava動作環境が必要です。JAVAをダウンロード
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更新日：2008年1月 1日 | 本記事のURL
MarvinSpace イメージギャラリー
1AIDのバインディングポケット
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| レジデューラベルを表示 | リガンドポテンシャル表面 | ポケットの2次構造 |
2次構造
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| レジデューとB-factorの着色 | 着色方法のカスタマイズ例 | 2次構造のラベリング |
分子表面
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| CPK | コノリー表面 | 溶媒接触表面 |
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| ファンデルワールス | 温度因子によるコノリー表面 | レインボー表示 |
ガウシャンキューブファイル
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| 同値面静電ポテンシャル | 静電ポテンシャルのマップ | 分子軌道 |
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