MarvinSketchについて
MarvinSketchは、化学構造・クエリー・反応などを描画するための化学構造エディターです。
豊富な描画機能:
- 様々な種類のファイル形式をサポート: MOL、MOL2、SDF、RXN、RDF (V2000/V3000)、SMILES、SMARTS/SMIRKS (再帰的)、MRV、InChi、CML、PDB 他
- 他の化学構造エディター間でのコピー&ペースト
- 短縮形表記グループ
- 豊富に用意された構造テンプレート とマイテンプレート機能
- 3次元構造の編集
- 3次元座標/配座の発生
- 2次元構造のクリーニング/配座の発生
- 豊富なクエリー機能(汎用クエリー原子/ボンド、Atomリスト/NOTリスト、クエリープロパティ、pseudo原子、multipleグループ、リンクノード 他)
- 複数ページの作成・印刷のサポート
- 図形・矢印・テキストボックスの描画と整形
- 構造へのアノテーション
- 様々なスタイル定義(色、構造表記 他)
化学認識
- MarvinSketchから直接呼び出せる様々な化学計算プラグイン(化学計算についての詳細はCalculator Pluginを参照してください)
- エラーチェック(価数/反応式エラー)
- 構造クエリー(R-logic、SMARTS表記 他)
- アイソトープ、電荷、ラジカル、孤立電子対、短縮形表記のサポート
- 反応式描画時の手動/自動原子マッピング
- 立体化学の取り扱い(E/Z二重結合、R/Sキラリティ、ABS/OR/AND拡張ステレオ 他)
複数プラットフォームへの提供
- Marvinは、ほぼ全ての主要OSで使用できます。また、以下の提供形態があります:
- Java Applets ユーザー側でのソフトウェア、プラグインのインストールを必要とせず、JavaをサポートするWebブラウザー上で起動します。
- Java Beans スタンドアローンなデスクトップアプリケーションとして、またJavaベースのアプリケーションに移植して使用できます。
- Java Web Start エンドユーザーアプリケーションとして、Web経由で配布可能です。
- .NET package .NETアプリケーションに移植して使用できます。