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JChem Base:構造検索エンジン
高速かつ高度な構造/反応検索をサポート
JChem Baseは高速な検索アルゴリズムを搭載し、完全一致検索、部分構造検索、類似構造検索、スーパーストラクチャー検索、反応検索、さらに業界初のマーカッシュ(Markush)検索をサポートしています。
また、これらの検索時には次のような複雑なクエリーを用いることができます。
- SMARTSのサポート
- アトムリスト、ノットリスト、スーパーアトム
- チャージ、アイソトープ、ラジカル
- 水素数、芳香族/脂肪族原子
- リングサイズ、コネクティビティー ボンドタイプ、リング/チェイン
- Rグループ
- ステレオケミストリー
様々なリレーショナルデータベースをサポート
JChem BaseはOracleをはじめ、SQL Server、MySQL、DB2、PostgreSQLなどをサポートしており、使用目的に合わせて最適なリレーショナルデータベース管理システムを選択できます。
Jchem BaseはGUI管理ツールを提供しており、データベース管理者は容易にテーブルの作成、構造データのインポート/エクスポートができます。
開発効率の高いAPIを提供
JChem BaseはJavaおよび.NET(JNBridge経由)対応の使い易いAPIを提供しております。構造検索や表示、化学的なデータのハンドリングをスムーズに行うことが出来ます。特にWebアプリケーションの開発のし易さで定評があります。
様々なクライアントからアクセスが可能
デスクトップ製品のInstantJChemをはじめWebアプリケーションやEXCEL,Spotfire,SciTegic PipelinePilotなどのサードパーティーアプリケーションからアクセスが可能です。
化学的パラメータの組み合わせ(ケミカルターム)による検索
ケミカルタームとはChemAxonが考案した化学的ルールを記述するための言語で、化合物の物理化学的パラメータなどを複数組み合わせて、検索や条件設定に用いる事ができます。
JChem Baseでは、例えば、「任意の部分構造をもつリードライクな化合物」あるいは、「ある構造に類似したバイオアバイラビリティーの優れた化合物」といった条件で検索が行えるようになります。ケミカールタームで用いるパラメータは、検索実行時にオンザフライで計算されます。予め計算したプロパティーをデータベースに格納する必要はありません。(本機能のご利用にはCalculator Pluginが必要です。)
関連リンク(英語)
- Download
- Online tryout (Java required)
- History of Changes
- User Guide
- Developer Guide
- JChem FAQ
- JChem technical introduction
- Brochure
- Technical presentation
- Structure search overview
- Articles and Presentations
- Chemical Terms
更新日:2008年1月 1日 | 本記事のURL
